L'integration de packagekit/gnome/fedora devenant très tenu il n'est plus possible d'enlever le package.
C'est très ennuyeux car il tourne sous chaque compte utilisateur et est très peu approprié pour une gestion centralisée des configurations des machines.
Il semble que la direction prise par fedora est de dire que il faut que la distro soit faite de tous les composants comme le temoigne la querelle de ce bug.
Heureusement j'ai trouvé comment empecher packagekit de tourner (grace à ce post) :
vi /etc/yum/pluginconf.d/refresh-packagekit.conf
=> enabled=0